77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0642 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  100 
 
 		 464 aa  952    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  51.51 
 
 		 462 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  52.37 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  50.43 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  50.65 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  51.33 
 
 		 459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  50.44 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  51.08 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  50.44 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  48.81 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  49.89 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  50.54 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  50.11 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  49.01 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  50.68 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  49.36 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  47.47 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  49.78 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  47.4 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  47.26 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  47.45 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  47.94 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  49.12 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  49.67 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  47.87 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  50.11 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  47.66 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  47.97 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  47.66 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  48.25 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  47.25 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  43.92 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  44.56 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  44.56 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  44.56 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  44.56 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  44.56 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  44.56 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  44.56 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  44.35 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  44.35 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  43.35 
 
 		 472 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  43.4 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  40.57 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  38.68 
 
 		 481 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  42.4 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  39.04 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  38.82 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  38.82 
 
 		 482 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  38.16 
 
 		 482 aa  326  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  38.38 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  37.5 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  30.82 
 
 		 4614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  30.94 
 
 		 2653 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  30.94 
 
 		 2726 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  30.47 
 
 		 4539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  31.18 
 
 		 4555 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  25.51 
 
 		 1558 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  25.51 
 
 		 1563 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  25.51 
 
 		 1557 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  32.78 
 
 		 7149 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  27.96 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  28.96 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  25 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  29.3 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  25.91 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.27 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  25.2 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  24.39 
 
 		 341 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  27.07 
 
 		 343 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  26.11 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  26.11 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  25.74 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  26.09 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  22.65 
 
 		 339 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0879  mannose-6-phosphate isomerase  30.82 
 
 		 359 aa  44.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  27.62 
 
 		 348 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>