64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3438 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  85.31 
 
 
471 aa  839    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  85.9 
 
 
471 aa  839    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  65.04 
 
 
459 aa  642    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  100 
 
 
474 aa  978    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  65.27 
 
 
457 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  64.47 
 
 
458 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  53.03 
 
 
462 aa  526  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  53.08 
 
 
473 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  54.19 
 
 
462 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  52.54 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  52.08 
 
 
461 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  50.98 
 
 
458 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  51.87 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  51.52 
 
 
466 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  49.34 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  50.77 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  50.33 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  50.43 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  48.57 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  50 
 
 
466 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  49.67 
 
 
464 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  49.78 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  48.48 
 
 
465 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  44.2 
 
 
459 aa  437  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  47.69 
 
 
456 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  47.47 
 
 
456 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  45.95 
 
 
462 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  48.05 
 
 
462 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  47.38 
 
 
469 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  44.87 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  45.26 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  45.26 
 
 
471 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  45.26 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  45.26 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  45.26 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  45.26 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  44.44 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  44.87 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  45.45 
 
 
450 aa  398  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  44.66 
 
 
471 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  42.62 
 
 
489 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  44.59 
 
 
472 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  45.13 
 
 
450 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  43.08 
 
 
487 aa  378  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  40.4 
 
 
482 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  41.24 
 
 
481 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  40.62 
 
 
482 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  39.96 
 
 
479 aa  363  3e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  39.96 
 
 
482 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  39.26 
 
 
482 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  39.07 
 
 
482 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  41.43 
 
 
460 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  31.29 
 
 
2653 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  31.29 
 
 
2726 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  31.29 
 
 
4614 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  30.94 
 
 
4539 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  31.29 
 
 
4555 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  27.53 
 
 
1558 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  27.53 
 
 
1563 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  27.53 
 
 
1557 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  29.43 
 
 
7149 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  26.87 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  27.27 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  23.89 
 
 
339 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>