62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0376 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  100 
 
 		 489 aa  1006    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  70.56 
 
 		 487 aa  712    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  61.38 
 
 		 481 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  59.71 
 
 		 479 aa  629  1e-179  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  59.25 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  60.33 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  60.33 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  59.92 
 
 		 482 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  58.87 
 
 		 482 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  45.23 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  45.33 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  45.31 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  45.09 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  43.33 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  42.62 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  41.78 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  40.62 
 
 		 462 aa  361  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  41.46 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  39.65 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  38.46 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  38.75 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  40.89 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  38.16 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  40.57 
 
 		 464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  38.21 
 
 		 466 aa  340  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  37.15 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  39.25 
 
 		 450 aa  333  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  37.78 
 
 		 462 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  39.34 
 
 		 456 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  36.97 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  38.31 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  38.5 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  37.17 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  38.48 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  38.17 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  36.36 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  38.17 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  37.14 
 
 		 456 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  36.18 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  35.57 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  36.83 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  35.14 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  34.71 
 
 		 471 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  34.71 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  34.71 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  34.71 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  34.71 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  34.71 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  34.71 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  34.71 
 
 		 471 aa  292  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  34.49 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  34.5 
 
 		 460 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  22.34 
 
 		 1563 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  22.34 
 
 		 1558 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  22.34 
 
 		 1557 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  27.03 
 
 		 4614 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  27.03 
 
 		 4539 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  27.41 
 
 		 4555 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  27.03 
 
 		 2726 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  27.03 
 
 		 2653 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  27.09 
 
 		 7149 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  25.37 
 
 		 331 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>