64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1401 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1401  tryptophanase  100 
 
 		 459 aa  953    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  57.64 
 
 		 462 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  56.11 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  56.51 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  56.42 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  54.51 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  53.96 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  50.44 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  53.04 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  51.73 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  52.61 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  51 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  50.87 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  52.99 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  50.88 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  50.78 
 
 		 457 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  51.21 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  51.33 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  49.78 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  50.11 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  50.44 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  48.11 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  49.34 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  48.56 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  47.33 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  49.78 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  47.9 
 
 		 450 aa  438  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  47.58 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  47.86 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  46.12 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  46.57 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  45.13 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  46.51 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  46.14 
 
 		 471 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  46.14 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  46.14 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  46.14 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  45.92 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  45.92 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  46.14 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  46.14 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  46.14 
 
 		 471 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  40.66 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  40.89 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  37.3 
 
 		 482 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  37.08 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  37.56 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  37.08 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  36.78 
 
 		 487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  36.4 
 
 		 482 aa  306  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  36.18 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  35.03 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  26.84 
 
 		 4539 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  26.84 
 
 		 4614 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  26.84 
 
 		 4555 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  26.55 
 
 		 2653 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  26.55 
 
 		 2726 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  26.71 
 
 		 7149 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  26.64 
 
 		 1557 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  26.64 
 
 		 1563 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  26.64 
 
 		 1558 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  23.65 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  30.86 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  24.3 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>