66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1624 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  100 
 
 		 462 aa  939    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  69.01 
 
 		 455 aa  631  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  60.65 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  59.43 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  58.02 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  59.78 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  54.97 
 
 		 469 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  54.34 
 
 		 456 aa  501  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  51.11 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  47.02 
 
 		 462 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  48.57 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  48.91 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  47.37 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  50.11 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  46.8 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  48.27 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  47.31 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  46.51 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  47.29 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  47.1 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  48.05 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  46.02 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  47.4 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  44.44 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  48 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  45.59 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  44.93 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  49.33 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  44.3 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  44.42 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  44.42 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  47.33 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  43.31 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  42.95 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  42.09 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  41.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  41.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  41.88 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  41.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  41.88 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  41.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  41.88 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  41.67 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  40.18 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  39.38 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  38.94 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  36.75 
 
 		 489 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  39.38 
 
 		 482 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  39.16 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  38.5 
 
 		 482 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  37.5 
 
 		 487 aa  299  8e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  34.89 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  33.24 
 
 		 2726 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  33.24 
 
 		 2653 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  33.24 
 
 		 4539 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  32.95 
 
 		 4555 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  33.53 
 
 		 4614 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  31.1 
 
 		 1563 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  31.1 
 
 		 1558 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  31.1 
 
 		 1557 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  32.22 
 
 		 7149 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  30.34 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1718  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.69 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.592829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6417  aminotransferase class-III  34.34 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  24.02 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  24.41 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>