65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03592 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  100 
 
 
471 aa  982    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  85.11 
 
 
472 aa  851    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  99.79 
 
 
471 aa  980    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  100 
 
 
471 aa  982    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  100 
 
 
471 aa  982    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  88.32 
 
 
471 aa  877    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  100 
 
 
471 aa  982    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  99.79 
 
 
471 aa  981    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  99.79 
 
 
471 aa  979    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  99.79 
 
 
471 aa  981    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  982    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  58.21 
 
 
466 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  57.57 
 
 
466 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  57.14 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  56.72 
 
 
477 aa  538  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  55.22 
 
 
465 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  54.62 
 
 
462 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  54.8 
 
 
462 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  53.45 
 
 
473 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  52.47 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  54.31 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  48.83 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  48.72 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  47.2 
 
 
458 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  47.41 
 
 
457 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  47.2 
 
 
462 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  43.97 
 
 
469 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  46.14 
 
 
459 aa  418  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  44.8 
 
 
459 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  45.34 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  45.09 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  45.69 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  45.26 
 
 
474 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  44.44 
 
 
471 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  41.36 
 
 
464 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  42.22 
 
 
456 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  42.31 
 
 
456 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  44.56 
 
 
464 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  41.13 
 
 
456 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  41.24 
 
 
462 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  40.91 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  41.16 
 
 
450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  38.54 
 
 
460 aa  335  7e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  36.75 
 
 
479 aa  306  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  36.85 
 
 
482 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  34.71 
 
 
489 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  36.85 
 
 
482 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  34.75 
 
 
487 aa  288  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  35.78 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  33.62 
 
 
481 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  35.13 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  33.84 
 
 
482 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  26.18 
 
 
2726 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  26.18 
 
 
2653 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  25.91 
 
 
4539 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  25.91 
 
 
4555 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  25.91 
 
 
4614 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  28.23 
 
 
7149 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  23.06 
 
 
1557 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  23.58 
 
 
1558 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  23.58 
 
 
1563 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.32 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  23.33 
 
 
343 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  23.3 
 
 
343 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  23.3 
 
 
343 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>