64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1032 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  72.9 
 
 		 466 aa  724    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  68.2 
 
 		 462 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  72.47 
 
 		 477 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  100 
 
 		 462 aa  956    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  72.26 
 
 		 465 aa  729    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  66.3 
 
 		 462 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  74.62 
 
 		 466 aa  738    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  75.48 
 
 		 466 aa  750    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  63.42 
 
 		 473 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  62.69 
 
 		 461 aa  614  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  56.09 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  57.23 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  54.21 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  55.01 
 
 		 471 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  54.58 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  54.8 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  54.8 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  54.8 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  54.8 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  54.8 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  55.22 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  54.8 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  54.82 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  54.58 
 
 		 471 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  53.96 
 
 		 459 aa  500  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  54.17 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  53.39 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  51.52 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  51.31 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  50 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  49.67 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  51.31 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  48.57 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  50.54 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  50 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  50.22 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  50.33 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  49.78 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  49.35 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  47.15 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  46.85 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  46.83 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  41.59 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  39.65 
 
 		 489 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  40.17 
 
 		 481 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  39.61 
 
 		 482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  38.29 
 
 		 482 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  40.31 
 
 		 487 aa  329  6e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  37.04 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  38.38 
 
 		 482 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  37.86 
 
 		 482 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  37.01 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  25.68 
 
 		 2726 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  25.68 
 
 		 2653 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  24.93 
 
 		 4539 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  24.93 
 
 		 4614 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  24.93 
 
 		 4555 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  28.09 
 
 		 7149 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  23.57 
 
 		 1558 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  23.57 
 
 		 1557 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  23.57 
 
 		 1563 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  24.17 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  24.17 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  24.69 
 
 		 353 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>