65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0320 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  85.9 
 
 		 474 aa  828    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  95.54 
 
 		 471 aa  937    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  100 
 
 		 471 aa  970    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  63.94 
 
 		 459 aa  632  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  63.5 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  62.94 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  53.59 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  53.76 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  54.65 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  53.44 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  52.97 
 
 		 461 aa  501  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  50.66 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  50.11 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  51.31 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  50.87 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  49.78 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  50.11 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  49.57 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  48.7 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  47.67 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  50 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  50.44 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  44.18 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  48.12 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  48.34 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  47.37 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  47.54 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  47.3 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  47.02 
 
 		 469 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  45.09 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  44.87 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  44.66 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  46.1 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  44.44 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  44.44 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  44.44 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  44.44 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  44.44 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  44.23 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  44.44 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  44.44 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  44.35 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  43.3 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  41.65 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  44.25 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  40.31 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  40.09 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  40.09 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  39.41 
 
 		 482 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  38.75 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  41.24 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  39.04 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  29.03 
 
 		 2726 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  29.03 
 
 		 2653 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  29.03 
 
 		 4614 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  28.74 
 
 		 4539 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  29.03 
 
 		 4555 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  27.84 
 
 		 7149 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  27.15 
 
 		 1558 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  27.15 
 
 		 1563 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  27.15 
 
 		 1557 aa  86.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0960  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  24.14 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  24.24 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0439  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  22.88 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00930818  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  24.44 
 
 		 339 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>