65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0251 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0251  tryptophanase  100 
 
 		 459 aa  949    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000036462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1324  tryptophanase  71.9 
 
 		 462 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20900  tryptophanase  60.52 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0309  tryptophanase  57.58 
 
 		 461 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2460  tryptophanase  58.94 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2018  tryptophanase  55.19 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1032  tryptophanase  56.09 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06709  tryptophanase  54.09 
 
 		 477 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0587  tryptophanase  53.55 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000805  tryptophanase  53.66 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0147193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0626  tryptophanase  52.9 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3916  tryptophanase  52.07 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2022  tryptophanase  52.76 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1401  tryptophanase  50.88 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.331984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3931  tryptophanase  50.11 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0694288  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0829  Tryptophanase  48.9 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486815  normal  0.682269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1948  Tryptophanase  49.78 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0642  Tryptophanase  48.81 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49505  predicted protein  50.44 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0369192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1802  tyrosine phenol-lyase  47.38 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00367591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0866  tyrosine phenol-lyase  45.27 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5139  tryptophanase  48.93 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  normal  0.24086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4075  tryptophanase  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4286  tryptophanase  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03536  hypothetical protein  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4217  tryptophanase  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4259  tryptophanase  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1117  tryptophanase  50 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03592  tryptophanase/L-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2475  tryptophanase  48.9 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0801  tryptophanase  48.72 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000525745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0320  tyrosine phenol-lyase  44.18 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666084  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3922  tryptophanase  48.5 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1118  tyrosine phenol-lyase  47.16 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1723  tyrosine phenol-lyase  46.72 
 
 		 457 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4214  tryptophanase  48.72 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1760  tryptophanase  48.34 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637839  normal  0.596777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1624  tryptophanase  47.59 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4875  tryptophanase  46.27 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3438  tyrosine phenol-lyase  44.2 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00561885  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1937  Tryptophanase  44.69 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0018  Tryptophanase  45.7 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37510  tryptophanase  44.91 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0376  tryptophanase  38.75 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1995  tryptophanase  37.42 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.383478  normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3640  tryptophanase  36.28 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  37.31 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4083  tryptophanase  36.73 
 
 		 482 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1789  tryptophanase  36.2 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1966  tryptophanase  36.2 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0932  tryptophanase  36.06 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  hitchhiker  0.000000000350683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2787  tryptophanase  37.09 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163221  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  27.07 
 
 		 7149 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  26.14 
 
 		 2726 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  26.14 
 
 		 2653 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  26.88 
 
 		 4539 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  26.88 
 
 		 4555 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  26.88 
 
 		 4614 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1481  polyketide synthase  26.33 
 
 		 1558 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1396  polyketide synthase, type I  26.33 
 
 		 1563 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0002  putative polyketide synthase  26.33 
 
 		 1557 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  25.82 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  25.82 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  24.15 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1626  Glycine hydroxymethyltransferase  26.79 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696145  normal  0.61537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>