252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2438 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  61.01 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  58.16 
 
 		 302 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  58.48 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  58.16 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  59.57 
 
 		 319 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  50.88 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  46.24 
 
 		 338 aa  232  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  44.57 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  42.14 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  43.21 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  41.98 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  42.51 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  41.28 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  43.07 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  41.7 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  43 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  40.93 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  42.25 
 
 		 320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  40.64 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  40.91 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  42.21 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  42.61 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  42.25 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  38.06 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  40.93 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  39.86 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  40.28 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  40.28 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  38.64 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  41.34 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1598  hypothetical protein  39.72 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.426168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  42.91 
 
 		 322 aa  208  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  40.7 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  40 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  38.11 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  40.64 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  41.37 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  41.37 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  41.37 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  43.36 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  38.97 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  40.78 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  40.99 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  41.44 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  36.97 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  40.43 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  39.58 
 
 		 284 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1774  hypothetical protein  42.31 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  38.87 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  38.87 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  37.86 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  39.22 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  41.49 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  42.35 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  37.89 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  41.79 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15170  predicted P-loop-containing kinase  39.8 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  39.8 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  43.71 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02223  hypothetical protein  38.97 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.470659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  43.71 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  43.71 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3328  hypothetical protein  41.11 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  37.89 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  37.32 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  39.23 
 
 		 314 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  38.35 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  39.93 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  40.49 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  39.01 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  39.15 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  38.1 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  38.44 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  39.22 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  40.99 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  39.24 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3101  hypothetical protein  41.48 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0228836  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0867  hypothetical protein  38.89 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  39.93 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1502  hypothetical protein  38.41 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0573534  hitchhiker  0.00284622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  39.23 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  38.19 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  37.63 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  39.24 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  38.71 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  37.63 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  37.63 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  37.63 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  36.62 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>