252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1502 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1502  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0573534  hitchhiker  0.00284622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  71.03 
 
 
293 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1774  hypothetical protein  63.54 
 
 
294 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  60.14 
 
 
310 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1598  hypothetical protein  57.84 
 
 
294 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.426168  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0147  hypothetical protein  53.85 
 
 
295 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0092494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  41.7 
 
 
295 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  42.27 
 
 
294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  41.75 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  39.22 
 
 
284 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  41.49 
 
 
283 aa  222  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  41.67 
 
 
303 aa  221  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  40.14 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  40.35 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  40.7 
 
 
293 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  40.77 
 
 
294 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  39.24 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  40.83 
 
 
294 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  42.46 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  42.11 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  40.83 
 
 
294 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  41.92 
 
 
295 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  40.83 
 
 
294 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  42.11 
 
 
284 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  41.4 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  39.37 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  39.37 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  41.55 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  41.75 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  41.4 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  41.4 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  42.47 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0503  hypothetical protein  39.24 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  40.64 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  39.22 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  34.86 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  38.95 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  39.44 
 
 
288 aa  212  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  39.86 
 
 
285 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  40.7 
 
 
284 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  40.7 
 
 
284 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  40.7 
 
 
284 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  39.18 
 
 
303 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  39.18 
 
 
303 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  39.16 
 
 
285 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  40.43 
 
 
296 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  40.99 
 
 
312 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  38.33 
 
 
294 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  38.49 
 
 
295 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  39.24 
 
 
288 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  37.68 
 
 
291 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  39.44 
 
 
296 aa  209  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  38.81 
 
 
287 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  38.46 
 
 
287 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  38.19 
 
 
328 aa  209  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  41.67 
 
 
319 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  40.28 
 
 
302 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  37.85 
 
 
293 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  40.7 
 
 
288 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  41.52 
 
 
327 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  41.87 
 
 
299 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  38.6 
 
 
314 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  38.38 
 
 
281 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  38.11 
 
 
294 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  36.36 
 
 
305 aa  205  9e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  39.22 
 
 
294 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  39.02 
 
 
322 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  37.76 
 
 
285 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  39.93 
 
 
305 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  39.93 
 
 
305 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  39.93 
 
 
305 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  38.14 
 
 
326 aa  202  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  38.16 
 
 
294 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  39.8 
 
 
301 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  39.49 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>