252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2043 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  60.27 
 
 		 302 aa  363  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  60.47 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  62.68 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  60.49 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  61.97 
 
 		 294 aa  346  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  61.75 
 
 		 289 aa  345  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  60.76 
 
 		 289 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  60 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  58.45 
 
 		 323 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  60.14 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  60.14 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  60.14 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  59.09 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  53.11 
 
 		 319 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3101  hypothetical protein  58.94 
 
 		 302 aa  315  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0228836  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  56.54 
 
 		 290 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  55.33 
 
 		 301 aa  309  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  55.79 
 
 		 300 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3328  hypothetical protein  59.19 
 
 		 295 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3013  hypothetical protein  60.21 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2934  hypothetical protein  54.58 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  54.01 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  56.79 
 
 		 286 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  53.4 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1253  hypothetical protein  50.33 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  53.87 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  51.21 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0910  ATPase, AAA family  49.3 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  50.53 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0430  hypothetical protein  49.67 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  49.04 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  52.11 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11310  hypothetical protein  49.83 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.339537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1824  hypothetical protein  49.82 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000231232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2360  hypothetical protein  50.34 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  46.62 
 
 		 285 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  46.45 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15170  predicted P-loop-containing kinase  47.18 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  45.77 
 
 		 285 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1946  hypothetical protein  48.68 
 
 		 313 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  43.66 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  42.16 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  43.42 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  45.77 
 
 		 294 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  45.77 
 
 		 294 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  43.66 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  47.72 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  46.29 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  41.81 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  44.52 
 
 		 298 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  42.96 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  46.48 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  46.29 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  48.42 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  48.42 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  46.64 
 
 		 288 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  44.52 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  45.39 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  48.24 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  41.2 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  43.26 
 
 		 285 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  45.26 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  43.79 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  43.45 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  45.02 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  42.35 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  43.1 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  43.1 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  43.1 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  45.45 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  41.13 
 
 		 291 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  41.55 
 
 		 287 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  43.71 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  42.09 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  43.51 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  39.3 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  41.69 
 
 		 303 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  41.69 
 
 		 303 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  43.25 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  45.07 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  42.56 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  43.06 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  40.64 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  41.12 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  44.64 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  41.61 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  41.55 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  40.93 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  39.58 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  39.64 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  42.76 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  44.82 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>