252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0910 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0910  ATPase, AAA family  100 
 
 		 319 aa  656    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0430  hypothetical protein  71.38 
 
 		 328 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  53.38 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  54.26 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1253  hypothetical protein  55.67 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  51.02 
 
 		 297 aa  318  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1946  hypothetical protein  51.35 
 
 		 313 aa  312  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  51.59 
 
 		 294 aa  311  9e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  50.88 
 
 		 307 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2934  hypothetical protein  48.47 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  52.11 
 
 		 295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1824  hypothetical protein  51.24 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000231232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  51.06 
 
 		 294 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  50.35 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  50.7 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  51.58 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11310  hypothetical protein  52.26 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.339537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  49.12 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  47.64 
 
 		 301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  49.3 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  48.75 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  47.7 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  49.12 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  46.88 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  51.07 
 
 		 286 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  50.75 
 
 		 301 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  46.62 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  48.59 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  47.52 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  48.59 
 
 		 305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  48.59 
 
 		 305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  48.59 
 
 		 305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3101  hypothetical protein  48.89 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0228836  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15170  predicted P-loop-containing kinase  43.31 
 
 		 298 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3013  hypothetical protein  48.71 
 
 		 294 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  46.64 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3328  hypothetical protein  46.67 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  41.18 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  45.49 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2360  hypothetical protein  46.42 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  43.86 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  42.91 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  42.91 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  43.16 
 
 		 291 aa  245  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  42.46 
 
 		 294 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  42.91 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  43.21 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  42.55 
 
 		 285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  42.36 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  42.61 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  42.25 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  42.81 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  39.93 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  43.37 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  42.25 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  41.36 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  40.43 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  39.72 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  40.68 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40.68 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40.68 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  44.14 
 
 		 352 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  40.68 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  40.46 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  42.11 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  42.86 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  40.34 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  40.34 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  40.34 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  40.34 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  40.68 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  40.34 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  42.61 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  41.54 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  41.49 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  44.02 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  42.27 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  40.66 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  39.72 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  38.73 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  40.43 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  42.16 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  37.76 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  38.98 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  42.34 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  42.01 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  42.01 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  39.36 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  39.93 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  39.33 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  39.44 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  39.15 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  38.62 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  41.73 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  39.01 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  39.36 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0147  hypothetical protein  38.91 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0092494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  40.14 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>