252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1935 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  54.39 
 
 
285 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  54.06 
 
 
288 aa  315  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  53.71 
 
 
285 aa  311  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  53.36 
 
 
287 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  53.36 
 
 
287 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  50.88 
 
 
287 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  49.82 
 
 
285 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  48.94 
 
 
294 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  49.65 
 
 
294 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  49.65 
 
 
294 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  46.29 
 
 
320 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  45.61 
 
 
319 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  45.39 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  47.75 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  43.36 
 
 
297 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  45.07 
 
 
305 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  45.07 
 
 
305 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  45.07 
 
 
305 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  41.55 
 
 
302 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  43.82 
 
 
294 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  44.41 
 
 
327 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  44.88 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  42.36 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  43.62 
 
 
303 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  45.58 
 
 
289 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  45.23 
 
 
289 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  41.9 
 
 
298 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  44.44 
 
 
288 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  41.9 
 
 
284 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  42.25 
 
 
291 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  43.25 
 
 
311 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  40.42 
 
 
291 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  43.79 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  42.71 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  43.71 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  44.21 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  43.11 
 
 
294 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  41.2 
 
 
286 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  41.81 
 
 
296 aa  232  6e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  41.96 
 
 
283 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  41.61 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  41.61 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  41.9 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  41.9 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0503  hypothetical protein  42.01 
 
 
293 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  41.67 
 
 
294 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  42.01 
 
 
290 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  41.9 
 
 
291 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  41.55 
 
 
296 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  42.25 
 
 
293 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  42.25 
 
 
293 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  42.25 
 
 
293 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  42.25 
 
 
293 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  42.25 
 
 
293 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  41.9 
 
 
293 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  41.9 
 
 
293 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  41.9 
 
 
293 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  41.9 
 
 
293 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  41.55 
 
 
295 aa  228  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  45.17 
 
 
322 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  42.21 
 
 
287 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  44.37 
 
 
307 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  42.76 
 
 
323 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  40.28 
 
 
293 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  41.32 
 
 
288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  41.79 
 
 
303 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  40.62 
 
 
285 aa  224  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  41.79 
 
 
303 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  39.63 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  41.7 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  43.28 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2759  hypothetical protein  43.36 
 
 
281 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0611938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2934  hypothetical protein  40.77 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  42.86 
 
 
286 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  40.42 
 
 
301 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  40.85 
 
 
322 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  40.91 
 
 
352 aa  219  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  40.64 
 
 
300 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  43.71 
 
 
285 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12760  hypothetical protein  43.75 
 
 
285 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  40.42 
 
 
297 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  44.44 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  41.11 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  42.51 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  42.91 
 
 
285 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  43.36 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3490  hypothetical protein  44.07 
 
 
318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  39.24 
 
 
307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  41.34 
 
 
294 aa  215  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  38.68 
 
 
326 aa  215  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  42.05 
 
 
282 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  39.79 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3013  hypothetical protein  43.49 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  39.37 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  39.5 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  42.81 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  40.42 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0885  hypothetical protein  42.25 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>