252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0433 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  84.69 
 
 
303 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  84.69 
 
 
303 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  53.63 
 
 
293 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  53.29 
 
 
293 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  53.29 
 
 
293 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  53.29 
 
 
293 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  53.29 
 
 
293 aa  329  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  53.29 
 
 
293 aa  328  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  328  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  53 
 
 
297 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  51.92 
 
 
298 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  51.24 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  49.82 
 
 
288 aa  305  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  52.3 
 
 
291 aa  298  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  50.88 
 
 
291 aa  288  7e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  47.9 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  51.06 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  48.43 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  48.76 
 
 
296 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  50.18 
 
 
291 aa  278  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  46.53 
 
 
294 aa  276  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  48.07 
 
 
283 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  47.28 
 
 
294 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  47.28 
 
 
294 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  46.48 
 
 
295 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  46.15 
 
 
295 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  47.93 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  46.83 
 
 
297 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  46.02 
 
 
352 aa  265  8e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  44.9 
 
 
288 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  46.58 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  44.37 
 
 
328 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  46.8 
 
 
299 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  46.29 
 
 
294 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  43.51 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  43.31 
 
 
294 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  45.1 
 
 
294 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  42.51 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  42.05 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  41.55 
 
 
305 aa  243  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  45.33 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  42.86 
 
 
286 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  41.7 
 
 
289 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  41.92 
 
 
294 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  42.31 
 
 
290 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  41.34 
 
 
285 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  42.21 
 
 
285 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  42.16 
 
 
294 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  42.46 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  42.05 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  39.72 
 
 
300 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  42.4 
 
 
295 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  40.2 
 
 
305 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  42.4 
 
 
303 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  41.34 
 
 
285 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  44.14 
 
 
285 aa  229  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1253  hypothetical protein  40.14 
 
 
312 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  43.6 
 
 
294 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  43.6 
 
 
294 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  42.51 
 
 
294 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3013  hypothetical protein  43.12 
 
 
294 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  38.6 
 
 
307 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  40.28 
 
 
305 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  40.28 
 
 
305 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  40.28 
 
 
305 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  41.11 
 
 
282 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  41.55 
 
 
320 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1144  hypothetical protein  40.7 
 
 
287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  39.93 
 
 
319 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  225  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3490  hypothetical protein  40.68 
 
 
318 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  42.91 
 
 
281 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  41.24 
 
 
293 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  37.76 
 
 
301 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  40.14 
 
 
286 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  39.71 
 
 
312 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  39.18 
 
 
287 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  40.85 
 
 
301 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  39.22 
 
 
327 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  42.91 
 
 
280 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  40.62 
 
 
307 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  42.55 
 
 
281 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  38.14 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  38.23 
 
 
309 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0910  ATPase, AAA family  42.34 
 
 
319 aa  222  7e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1824  hypothetical protein  39.3 
 
 
307 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000231232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  39.63 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  38.52 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  39.72 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2360  hypothetical protein  39.86 
 
 
310 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2934  hypothetical protein  38.25 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  38.81 
 
 
314 aa  215  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0430  hypothetical protein  41.98 
 
 
328 aa  214  9e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>