252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2850 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  65.29 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  65.29 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  63.42 
 
 		 302 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  62.9 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  59.57 
 
 		 300 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  51.84 
 
 		 318 aa  288  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  46.6 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  43.58 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  43.4 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  44.13 
 
 		 338 aa  235  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  40.42 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  40.21 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  44.91 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  43.48 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  38.31 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  38.31 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  42.71 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  39.44 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  39.72 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  43.75 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  40.21 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  43.25 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  44.41 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  40.14 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  41.11 
 
 		 285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  40.97 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  38.52 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  42.31 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  43.75 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  41.05 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  42.12 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  41.05 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  38.57 
 
 		 296 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  39.12 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  42.07 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  37.76 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  40.82 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  42.61 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  39.93 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  42.31 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  37.98 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  40.34 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  40.86 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  41.52 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  39.24 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  40.7 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  40.21 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  39.58 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  40.21 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  43.01 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  40.21 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  40.7 
 
 		 284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  40.49 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  42.91 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  42.31 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  40.21 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  43.16 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  41.81 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  40.14 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  35.92 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  41.9 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  42.18 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  38.31 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2934  hypothetical protein  41.89 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1598  hypothetical protein  41.26 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.426168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  42.05 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  41.9 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1502  hypothetical protein  41.67 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0573534  hitchhiker  0.00284622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  40.48 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  41.1 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  40.99 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>