252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0424 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  593  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1502  hypothetical protein  71.03 
 
 
303 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0573534  hitchhiker  0.00284622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  60.49 
 
 
310 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1774  hypothetical protein  64.93 
 
 
294 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1598  hypothetical protein  60.28 
 
 
294 aa  362  4e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.426168  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0147  hypothetical protein  55.59 
 
 
295 aa  338  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0092494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  44.44 
 
 
293 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  42.4 
 
 
284 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  43.01 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  43.01 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  241  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  42.27 
 
 
297 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  42.81 
 
 
293 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  40.64 
 
 
295 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  41.96 
 
 
285 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  42.55 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  42.76 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  44.25 
 
 
303 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  42.86 
 
 
294 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  42.01 
 
 
294 aa  229  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  43.66 
 
 
295 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  43.51 
 
 
294 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  40.56 
 
 
285 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  41.61 
 
 
285 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  42.11 
 
 
298 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  40.99 
 
 
298 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  40.7 
 
 
286 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  42.61 
 
 
303 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  42.61 
 
 
303 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  41.78 
 
 
302 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  42.61 
 
 
294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  40.49 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  38.81 
 
 
305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  42.61 
 
 
294 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  42.61 
 
 
294 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  39.3 
 
 
285 aa  224  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  40.14 
 
 
294 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  41.24 
 
 
295 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  42.76 
 
 
320 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  43.71 
 
 
301 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  41.61 
 
 
322 aa  222  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  39.72 
 
 
291 aa  222  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  41.18 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  40.83 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  39.86 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  39.66 
 
 
287 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  41.49 
 
 
288 aa  219  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  40.28 
 
 
288 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  40.21 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  40.43 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  39.31 
 
 
287 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  42.12 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  40.07 
 
 
296 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0503  hypothetical protein  42.91 
 
 
293 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  42.76 
 
 
319 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  42.96 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  42.01 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  39.51 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  44.76 
 
 
285 aa  216  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  42.31 
 
 
319 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  39.44 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  40.28 
 
 
328 aa  215  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  40.94 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  42.4 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  38.46 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  37.28 
 
 
281 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  38.6 
 
 
291 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  39.65 
 
 
284 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  41.3 
 
 
323 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  40.07 
 
 
285 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  37.76 
 
 
282 aa  209  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  41.92 
 
 
311 aa  209  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  40.07 
 
 
284 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  40.07 
 
 
285 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  39.31 
 
 
284 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  41.55 
 
 
305 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  41.55 
 
 
305 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  41.55 
 
 
305 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  40.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  40.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  40.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  39.66 
 
 
284 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  41.44 
 
 
284 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  40.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  40.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  40.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>