252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0972 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  60.49 
 
 
293 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1502  hypothetical protein  60.14 
 
 
303 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0573534  hitchhiker  0.00284622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1774  hypothetical protein  55.59 
 
 
294 aa  331  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0244529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0147  hypothetical protein  54.9 
 
 
295 aa  329  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0092494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1598  hypothetical protein  51.54 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.426168  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  41.02 
 
 
307 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  43.21 
 
 
293 aa  238  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  40.43 
 
 
284 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  44.6 
 
 
302 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  42.51 
 
 
293 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  42.51 
 
 
293 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  42.16 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  42.51 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  41.32 
 
 
291 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  41.9 
 
 
295 aa  231  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  41.81 
 
 
293 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  42.36 
 
 
312 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  41.05 
 
 
293 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  39.51 
 
 
295 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  43.88 
 
 
295 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  41.12 
 
 
320 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  41.03 
 
 
298 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  42.31 
 
 
296 aa  228  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  43.31 
 
 
303 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  40.92 
 
 
314 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  43.16 
 
 
319 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  40.55 
 
 
303 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  41.28 
 
 
288 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  40.98 
 
 
311 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  43.75 
 
 
319 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  40.55 
 
 
303 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  40.14 
 
 
294 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  42.4 
 
 
294 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  40.35 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  39.86 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  39.86 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  39.12 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  41.4 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  38.54 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  41.2 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  42.46 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  43.84 
 
 
305 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1253  hypothetical protein  39.93 
 
 
312 aa  218  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  38.46 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  41.43 
 
 
288 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  36.97 
 
 
285 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  39.93 
 
 
291 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  42.01 
 
 
327 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  40.74 
 
 
301 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  39.58 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  40.73 
 
 
301 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  40.56 
 
 
282 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  40.21 
 
 
283 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  40.14 
 
 
294 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  41.34 
 
 
323 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  38.36 
 
 
305 aa  215  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  38.81 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  39.08 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  39.93 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  43.3 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  40.14 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  42.76 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0430  hypothetical protein  42.07 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  41.1 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  40.14 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  41.1 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  41.1 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  38.51 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  40.21 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  41.34 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  40.21 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  42.76 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  41.44 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  40.34 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  41.02 
 
 
307 aa  212  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  42.27 
 
 
309 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  36.97 
 
 
281 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  37.32 
 
 
281 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0910  ATPase, AAA family  40.14 
 
 
319 aa  210  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  39.51 
 
 
284 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  40.42 
 
 
284 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  38.83 
 
 
326 aa  208  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15170  predicted P-loop-containing kinase  38.41 
 
 
298 aa  208  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>