252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2562 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  93.05 
 
 
302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  92.38 
 
 
302 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  63.42 
 
 
319 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  63.12 
 
 
300 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  58.48 
 
 
300 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  50.69 
 
 
318 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  44.92 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  43.92 
 
 
303 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  44.44 
 
 
313 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  43.26 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  39.86 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  39.31 
 
 
293 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  39.66 
 
 
293 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  40.83 
 
 
298 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  38.62 
 
 
297 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  41.55 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  39.16 
 
 
297 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  40.91 
 
 
298 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  37.2 
 
 
295 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  44.33 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  43.3 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  36.43 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  43.49 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  37.33 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  43.9 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  39.86 
 
 
294 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  40.14 
 
 
297 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  37.72 
 
 
296 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  41.84 
 
 
298 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  38.03 
 
 
303 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  38.51 
 
 
293 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  38.03 
 
 
303 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  41.26 
 
 
289 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  41.9 
 
 
301 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  39.37 
 
 
285 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  40.14 
 
 
307 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  37.93 
 
 
291 aa  205  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  36.97 
 
 
284 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  38.52 
 
 
281 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  41.08 
 
 
305 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  41.08 
 
 
305 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  41.08 
 
 
305 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  36.52 
 
 
295 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  40.99 
 
 
319 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  37.81 
 
 
281 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  41.02 
 
 
289 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  40.14 
 
 
287 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  39.37 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  36.84 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  36.97 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  39.22 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  40.07 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  41.46 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  39.44 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  39.79 
 
 
287 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  40.61 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  39.19 
 
 
311 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  42.66 
 
 
322 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  38.81 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  40.07 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  39.14 
 
 
352 aa  196  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  39.16 
 
 
285 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  35.34 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  41.32 
 
 
294 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  34.49 
 
 
286 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2360  hypothetical protein  39.04 
 
 
310 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  40.07 
 
 
295 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  39.86 
 
 
305 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  39.45 
 
 
288 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  37.76 
 
 
291 aa  194  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  40.64 
 
 
301 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  41.4 
 
 
294 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  38.54 
 
 
288 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  37.89 
 
 
286 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  39.18 
 
 
290 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  38.03 
 
 
294 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  40.49 
 
 
286 aa  191  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  37.11 
 
 
290 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  38.18 
 
 
293 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  34.25 
 
 
291 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02223  hypothetical protein  37.68 
 
 
290 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.470659  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  39.06 
 
 
305 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1598  hypothetical protein  39.38 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.426168  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  35.79 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>