252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3448 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  49.15 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  51.23 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  49.82 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  48.06 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  46.98 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  49.15 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  44.29 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  43.51 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  42.81 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  42.46 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  44.13 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  46.24 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  45.61 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  41.2 
 
 		 286 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  44.56 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  43.11 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  42.76 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  44.33 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  44.06 
 
 		 293 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  41.26 
 
 		 285 aa  225  8e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  43.36 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  43.36 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  43.36 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  43.36 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  43.36 
 
 		 293 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  44.09 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  45.45 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  43.71 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  46.64 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  43.71 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  43.71 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  43.71 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  43.71 
 
 		 293 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  43.51 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  42.81 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  42.76 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  45.55 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  42.81 
 
 		 285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  45.36 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  40.35 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  38.65 
 
 		 281 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  43.55 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  43.16 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  42.81 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  40.94 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  44.17 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  39.02 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  43.86 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  42.05 
 
 		 285 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  41.25 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  41.26 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  41.75 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  41.26 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  41.75 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  44.21 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  41.4 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  37.81 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  44.21 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  37.37 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  40.36 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  41.81 
 
 		 284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  44.04 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  43.16 
 
 		 288 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  41.78 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  41.4 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  41.75 
 
 		 285 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03667  hypothetical protein  39.02 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  43.51 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  39.86 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  44.72 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  40.91 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  42.66 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  43.46 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  44.01 
 
 		 294 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  43.77 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  40.56 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  43.25 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  43.25 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  43.25 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  40.62 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  41.28 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>