252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2904 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  54.1 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  52.49 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  46.6 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  44.92 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  44.11 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  44.11 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  44.41 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  46.23 
 
 		 300 aa  248  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  43.1 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  44.52 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  40.64 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  40.28 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  40.49 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  40.49 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  40.49 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  40.97 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  39.04 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  42.75 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  39.08 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  38.49 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  40.88 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  39.45 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  38.14 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  40.85 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  40.91 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  41.46 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  39.18 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  39.66 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  39.66 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  37.68 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  36.24 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  37.28 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  39.02 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  36.71 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  39.79 
 
 		 288 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  37.46 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  38.51 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  40.56 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  34.93 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  38.83 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  35.86 
 
 		 286 aa  198  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  37.98 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  37.76 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  38.73 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  38.73 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  38.54 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  38.19 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  40.56 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  39.38 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  39.37 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  37.72 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  39.04 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  38.14 
 
 		 281 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  40.75 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  37.37 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  40.75 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  40.75 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  38.95 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  39.86 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  36.81 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  36.81 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  34.97 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  40.91 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0430  hypothetical protein  39.31 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  39.79 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  38.33 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  38.11 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  40.07 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  38.33 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  35.07 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  36.81 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  39.11 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  38.81 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  37.02 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  37.98 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  36.46 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  37.98 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  35.29 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  39.16 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  37.63 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  36.46 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  38.98 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  38.62 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  37.19 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  38.33 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>