252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0399 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  54.72 
 
 		 316 aa  342  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  52.49 
 
 		 305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  51.23 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  47.8 
 
 		 318 aa  255  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  45.57 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  44.44 
 
 		 302 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  48.6 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  43.43 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  43.43 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  43.62 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  43.48 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  48.43 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  49.48 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  48.43 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  43.49 
 
 		 356 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  42.51 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  43.71 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  41.78 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  41.02 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  43.34 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  40.62 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  42.51 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  40.62 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  41.25 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  44.44 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  44.44 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  44.44 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  42.91 
 
 		 320 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  44.6 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  42.66 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  41.34 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  38.96 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  41.87 
 
 		 288 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  41.4 
 
 		 287 aa  215  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  42.76 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  41.84 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  40.13 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  42.36 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  39.52 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  37 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  40.7 
 
 		 286 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  40.7 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  40.56 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  42.51 
 
 		 301 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  42.71 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  40.35 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  43 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  38.38 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  40.55 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  41.11 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  41.9 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  40.42 
 
 		 288 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  42.32 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  42.32 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  39.86 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  42.32 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  42.32 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  40.91 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  42.32 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  38.81 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  43 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  39.86 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  42.47 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  40.2 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  40.62 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  42.66 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  42.66 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  40.07 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  42.66 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  42.66 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  41.75 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  43.45 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  37.5 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  40.49 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  39.66 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  40.49 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  41.78 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  42.47 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  36.33 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  42.31 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  38.83 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  39.66 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  42.47 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  37.85 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  38.59 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>