252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1884 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  81.05 
 
 		 285 aa  477  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  75.44 
 
 		 288 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  66.32 
 
 		 287 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  65.96 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  61.75 
 
 		 285 aa  367  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  58.95 
 
 		 287 aa  364  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  54.39 
 
 		 288 aa  318  9e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  53.36 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  52.11 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  51.76 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  51.76 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  48.04 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  51.59 
 
 		 299 aa  271  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  50.18 
 
 		 288 aa  268  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  45.74 
 
 		 284 aa  268  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  47.87 
 
 		 286 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  44.91 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  47.5 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  47.87 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  43.36 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  46.62 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  45.07 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  44.13 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  44.91 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  46.81 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  43.21 
 
 		 294 aa  258  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  45.39 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0503  hypothetical protein  46.85 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  46.59 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  43.4 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  46.07 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  42.61 
 
 		 297 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  43.21 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  41.75 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  42.81 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  44.68 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  44.68 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  45.85 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  46.18 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  43.01 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  43.16 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  47.77 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  44.44 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  44.72 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  44.64 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  40.85 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  44.64 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  44.64 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  45.49 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  44.64 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  42.76 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  42.76 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  40.48 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  42.5 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  43.37 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  43.71 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  43.11 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  43.42 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  41.34 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  41.79 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0885  hypothetical protein  45.26 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1253  hypothetical protein  42.91 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  41.64 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  42.86 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2759  hypothetical protein  45.74 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0611938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  40.43 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  40 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  42.71 
 
 		 322 aa  231  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  42.55 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  39.86 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0424  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00671647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  42.86 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  45.16 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1946  hypothetical protein  43.51 
 
 		 313 aa  228  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  42.65 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0910  ATPase, AAA family  39.72 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1824  hypothetical protein  42.14 
 
 		 307 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000231232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  40.85 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  42.46 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0147  hypothetical protein  42.91 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0092494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  40.07 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11310  hypothetical protein  40.71 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.339537  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  39.29 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  41.49 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  40.91 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  41.26 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  40.49 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  39.93 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>