252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2544 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  65.19 
 
 
301 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  65.4 
 
 
319 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  65.26 
 
 
327 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  61.84 
 
 
305 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  61.84 
 
 
305 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  61.84 
 
 
305 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  60 
 
 
303 aa  344  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  59.65 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  57.62 
 
 
302 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  54.67 
 
 
294 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  53.52 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  54.33 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2360  hypothetical protein  55.33 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  54.96 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  54.01 
 
 
320 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  52.63 
 
 
289 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  51.19 
 
 
300 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  52.78 
 
 
289 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5612  hypothetical protein  49.06 
 
 
323 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1824  hypothetical protein  52.26 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000231232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2174  hypothetical protein  50.7 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  51.57 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2934  hypothetical protein  50.7 
 
 
304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1253  hypothetical protein  50.68 
 
 
312 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  52.07 
 
 
301 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3101  hypothetical protein  52.94 
 
 
302 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0228836  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  54.23 
 
 
286 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11310  hypothetical protein  47.89 
 
 
298 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.339537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3328  hypothetical protein  52.94 
 
 
295 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13080  predicted P-loop-containing kinase  47.19 
 
 
326 aa  278  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399753  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20060  predicted P-loop-containing kinase  50.35 
 
 
314 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0390166  normal  0.798605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0430  hypothetical protein  50.18 
 
 
328 aa  276  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  51.76 
 
 
312 aa  275  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15170  predicted P-loop-containing kinase  49.65 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0910  ATPase, AAA family  47.52 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3013  hypothetical protein  51.49 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1946  hypothetical protein  49.82 
 
 
313 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213981  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  45 
 
 
297 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  45.1 
 
 
294 aa  248  8e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  45.61 
 
 
294 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  43.11 
 
 
293 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  43.11 
 
 
293 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  44.01 
 
 
285 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  42.36 
 
 
288 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  43.11 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  43.11 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  42.11 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  43.46 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  43.11 
 
 
293 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  44.52 
 
 
285 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  242  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  42.76 
 
 
293 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  43.11 
 
 
285 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  41.81 
 
 
297 aa  238  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  45.96 
 
 
294 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  45.96 
 
 
294 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  41.7 
 
 
296 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  45.61 
 
 
294 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  42.2 
 
 
298 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  45.52 
 
 
322 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  40.43 
 
 
291 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  42.91 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  41.96 
 
 
284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  41.7 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  41.05 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  42.4 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  40.75 
 
 
298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  41.78 
 
 
352 aa  233  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  42.31 
 
 
322 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  41.96 
 
 
297 aa  232  5e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  39.65 
 
 
283 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  40.77 
 
 
303 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  40.64 
 
 
294 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  41.34 
 
 
294 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  40.77 
 
 
303 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  41.05 
 
 
294 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  41.05 
 
 
294 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  38.81 
 
 
287 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1129  hypothetical protein  37.76 
 
 
294 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  38.46 
 
 
287 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  43.24 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  40.85 
 
 
287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2024  hypothetical protein  40.07 
 
 
295 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2066  hypothetical protein  41.46 
 
 
286 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  40.28 
 
 
288 aa  222  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  44.25 
 
 
305 aa  222  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0433  hypothetical protein  38.23 
 
 
295 aa  222  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  40.7 
 
 
307 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  41.13 
 
 
288 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  38.25 
 
 
291 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  39.79 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1159  hypothetical protein  40.85 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  39.01 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  42.27 
 
 
310 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  43.31 
 
 
285 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  42.91 
 
 
319 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>