252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1902 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  54.34 
 
 
303 aa  292  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  49.25 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  43.49 
 
 
313 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  43.11 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  43.8 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  43.07 
 
 
300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  37.58 
 
 
302 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  37.58 
 
 
302 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  43.49 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  45.56 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  42.75 
 
 
305 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  40.22 
 
 
293 aa  198  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  38.97 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  40.96 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  43.64 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  39.78 
 
 
319 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  39.29 
 
 
297 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2759  hypothetical protein  40.74 
 
 
281 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0611938 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  37.55 
 
 
296 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  41.54 
 
 
285 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2360  hypothetical protein  41.37 
 
 
310 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  38.83 
 
 
295 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  39.78 
 
 
294 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  39.78 
 
 
288 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  40.5 
 
 
300 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2009  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  36.9 
 
 
285 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  39.49 
 
 
322 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  38.77 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  42.35 
 
 
320 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  39.02 
 
 
290 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  38.68 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  37.73 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  38.18 
 
 
285 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  40.21 
 
 
288 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  39.57 
 
 
302 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3333  hypothetical protein  41.02 
 
 
310 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  37.01 
 
 
298 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0113  hypothetical protein  36.5 
 
 
291 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  39.35 
 
 
309 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  40.22 
 
 
295 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  35.14 
 
 
284 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  39.49 
 
 
285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  37.32 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  37.59 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  40.59 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  40.79 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  36.4 
 
 
286 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  40.65 
 
 
319 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  40.91 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  39.13 
 
 
303 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  37.87 
 
 
283 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  37.96 
 
 
287 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  37.28 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  39.13 
 
 
294 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  37.59 
 
 
294 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1124  hypothetical protein  35.74 
 
 
281 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.974535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  38.6 
 
 
299 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  37 
 
 
281 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  35.51 
 
 
294 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  35.51 
 
 
294 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  41.67 
 
 
289 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  36.59 
 
 
303 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  36.76 
 
 
294 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  36.59 
 
 
303 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  39.42 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  39.19 
 
 
284 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  38.89 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1006  hypothetical protein  36.76 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0782476  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  38.89 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  38.89 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2290  hypothetical protein  35.04 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  39.19 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  38.83 
 
 
285 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  38.89 
 
 
284 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  36.03 
 
 
294 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  41.61 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  41.61 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  36.33 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  38.46 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  41.22 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  36.73 
 
 
297 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  38.83 
 
 
284 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  41.24 
 
 
294 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0672  hypothetical protein  36.57 
 
 
282 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  37.64 
 
 
282 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  40.29 
 
 
290 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  38.49 
 
 
287 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  38.13 
 
 
287 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  41.26 
 
 
301 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0741708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>