252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0209 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  63.12 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  63.12 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  63.12 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  62.9 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  61.01 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  55.32 
 
 		 318 aa  298  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  47.69 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  45.57 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  46.23 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  43.97 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  46.18 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  43.86 
 
 		 295 aa  235  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  43.16 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  40.99 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  43.69 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  42.46 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  43.11 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5259  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5683  hypothetical protein  40.91 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5316  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5274  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  40.42 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  42.81 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  41.52 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5004  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4833  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4848  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5384  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5240  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4948  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.051166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3698  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3054  hypothetical protein  40.47 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  43.9 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  39.86 
 
 		 283 aa  215  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  45.14 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  44.06 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  38.06 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  40.34 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  40.42 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  38.25 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  44.03 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  44.03 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  44.03 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  42.51 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  43.15 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  41.67 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  43.36 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  43.4 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  42.21 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  41.78 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  41.46 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3387  hypothetical protein  39.93 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  43.06 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  42.16 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0872  hypothetical protein  39.58 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1935  hypothetical protein  41.4 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2527  hypothetical protein  41.72 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.821572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  41.9 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  39.35 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  39.35 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  39.24 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  43.98 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  40.14 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4722  hypothetical protein  38.01 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  41.46 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  41.2 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10620  predicted P-loop-containing kinase  41.16 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  41.52 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  42.23 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  38.25 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02223  hypothetical protein  39.16 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.470659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  42.16 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0847  hypothetical protein  43.1 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  41.67 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07100  predicted P-loop-containing kinase  40.33 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.840647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  41.89 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  39.16 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  41.89 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  40.43 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  40.61 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0343  hypothetical protein  38.25 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0335  hypothetical protein  38.25 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1315  hypothetical protein  38.38 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00802998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  39.86 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  41.38 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  39.44 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  41.38 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  41.38 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  40.82 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  40.82 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  40.82 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  40.82 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>