252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2050 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  634    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.353923  normal  0.146066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2904  hypothetical protein  54.1 
 
 		 305 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0399  hypothetical protein  54.72 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0132201  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3448  hypothetical protein  48.79 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0209  hypothetical protein  43.97 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.77608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2850  hypothetical protein  43.58 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2562  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0446  hypothetical protein  42.05 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1684  hypothetical protein  39.58 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0539  hypothetical protein  46.5 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2438  hypothetical protein  42.14 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0317  hypothetical protein  39.58 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0152  hypothetical protein  45.26 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.216963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0125  hypothetical protein  40.14 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  40.56 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1902  hypothetical protein  43.8 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  40.56 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  40.56 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  40.56 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  40.56 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2396  hypothetical protein  45.42 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2443  hypothetical protein  45.42 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2437  hypothetical protein  45.42 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0875  hypothetical protein  40.99 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  39.51 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3782  hypothetical protein  41.32 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.208512  normal  0.538342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0147  hypothetical protein  45.33 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1111  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.140495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1884  hypothetical protein  40.85 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0154  hypothetical protein  44.98 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0165  hypothetical protein  44.98 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1047  hypothetical protein  38.95 
 
 		 295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  38.95 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2797  hypothetical protein  42.32 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000113308  decreased coverage  0.00000193831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1286  hypothetical protein  40.7 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0442782  hitchhiker  0.00000149713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  39.16 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  39.16 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  39.16 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  39.16 
 
 		 284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  39.16 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  38.46 
 
 		 284 aa  212  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2020  hypothetical protein  42.35 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2976  hypothetical protein  41.78 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854219  normal  0.0372996 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0386  hypothetical protein  38.6 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  44.33 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  43.6 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  43.36 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3147  hypothetical protein  37.67 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6041  hypothetical protein  41.46 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15790  hypothetical protein  39.8 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2060  hypothetical protein  43.42 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2970  hypothetical protein  37.46 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000268287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  42.11 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2698  hypothetical protein  41.02 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  38.49 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2163  hypothetical protein  38.73 
 
 		 285 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  41.96 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  41.61 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0972  hypothetical protein  40.07 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0531  hypothetical protein  37.82 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1634  hypothetical protein  41.99 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  37.81 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11450  hypothetical protein  42.24 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0741708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2195  hypothetical protein  43.82 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1783  hypothetical protein  42.21 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  41.26 
 
 		 284 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  40.14 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3714  hypothetical protein  41.2 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0300  hypothetical protein  40.77 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2544  hypothetical protein  41.55 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1996  hypothetical protein  42.35 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.806267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0320  hypothetical protein  37.24 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.822712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0416  hypothetical protein  40.57 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  40.56 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1178  hypothetical protein  38.03 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00313029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  40.56 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0977  hypothetical protein  37.72 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0258  hypothetical protein  40.7 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  40.14 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5205  hypothetical protein  41.16 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03667  hypothetical protein  39.18 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  39.3 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0926  hypothetical protein  37.92 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.410984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  40.91 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0262  hypothetical protein  38.03 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1621  hypothetical protein  39.52 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2043  hypothetical protein  42.55 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0790  hypothetical protein  37.63 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.950966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2083  hypothetical protein  41.26 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0806  hypothetical protein  37.63 
 
 		 303 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  42.31 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3941  hypothetical protein  38.6 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000293092  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  38.52 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4535  hypothetical protein  42.71 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0620241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0331  hypothetical protein  38.11 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  42.31 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1545  hypothetical protein  42.25 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.73341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2968  hypothetical protein  38.98 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.745593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15880  uncharacterized P-loop ATPase protein UPF0042  38.11 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000368631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  38.75 
 
 		 295 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>