252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0867 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12760  hypothetical protein  85.56 
 
 		 285 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4150  hypothetical protein  82.46 
 
 		 285 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0854  hypothetical protein  84.56 
 
 		 285 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4456  hypothetical protein  82.11 
 
 		 285 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0956  hypothetical protein  83.45 
 
 		 284 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.149336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0988  hypothetical protein  83.45 
 
 		 284 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0949  hypothetical protein  83.1 
 
 		 284 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5038  hypothetical protein  81.75 
 
 		 286 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57970  hypothetical protein  82.11 
 
 		 286 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4266  hypothetical protein  82.39 
 
 		 284 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3181  hypothetical protein  53.87 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2718  hypothetical protein  54.39 
 
 		 294 aa  323  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2229  hypothetical protein  52.1 
 
 		 298 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2797  hypothetical protein  51.93 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2233  hypothetical protein  51.4 
 
 		 288 aa  288  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0739  hypothetical protein  50.18 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0571  hypothetical protein  49.47 
 
 		 281 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03196  hypothetical protein  49.12 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0145  hypothetical protein  49.3 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4546  hypothetical protein  49.3 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3584  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3682  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3513  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3620  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3641  hypothetical protein  49.13 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.564975  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3515  hypothetical protein  49.48 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  49.47 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2130  hypothetical protein  46.32 
 
 		 287 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  49.83 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  49.13 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  49.13 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  49.47 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  49.14 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  49.13 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  48.96 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2112  hypothetical protein  46.85 
 
 		 286 aa  265  8e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0722  hypothetical protein  46.15 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3091  hypothetical protein  47.26 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.279163  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4243  hypothetical protein  47.59 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220847  hitchhiker  0.000000309991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0403  hypothetical protein  48.17 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.7432  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0258  hypothetical protein  47.68 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3314  hypothetical protein  46.48 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.304196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0285  hypothetical protein  47.68 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3964  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0670  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0669  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  normal  0.167586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0723  hypothetical protein  46.69 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3352  hypothetical protein  46.32 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00592419  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0592  hypothetical protein  47.78 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178282  hitchhiker  0.00532801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0070  hypothetical protein  47.02 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0495  hypothetical protein  44.41 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.159848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0350  hypothetical protein  47.83 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4126  hypothetical protein  47.78 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3380  hypothetical protein  45.45 
 
 		 287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0712  hypothetical protein  46.55 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000213655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0297  hypothetical protein  46.33 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0322  hypothetical protein  47.44 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002400  hypothetical ATP-binding protein UPF0042 contains P-loop  44.41 
 
 		 287 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0081  hypothetical protein  47.9 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0482  hypothetical protein  47.78 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2181  hypothetical protein  47.1 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0277901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2806  hypothetical protein  47.1 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.724657 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  45.3 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2795  hypothetical protein  47.1 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2629  hypothetical protein  46.05 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3021  ATPase  46.05 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0486  hypothetical protein  45.26 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.100542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0753  hypothetical protein  45.94 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.523032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0520  hypothetical protein  48.81 
 
 		 302 aa  248  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0771  hypothetical protein  47.52 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0495801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0713  hypothetical protein  45.61 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0521342  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6125  hypothetical protein  47.44 
 
 		 311 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.028257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3671  hypothetical protein  45.26 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000686834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0683  hypothetical protein  45.26 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0700496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0704  hypothetical protein  45.26 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.253725 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2855  hypothetical protein  48.46 
 
 		 311 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.801383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2713  hypothetical protein  48.46 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0577  hypothetical protein  47.1 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0593  hypothetical protein  47.1 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0667  hypothetical protein  45.23 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0950  hypothetical protein  45.58 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566704 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3112  hypothetical protein  46.76 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0761  hypothetical protein  46.76 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0080  hypothetical protein  46.76 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1510  hypothetical protein  46.76 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.782325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2938  hypothetical protein  46.76 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0529  hypothetical protein  47.37 
 
 		 278 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.402264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1915  hypothetical protein  45.95 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0746  hypothetical protein  43.16 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3336  hypothetical protein  44.14 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>