93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1669 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  43.39 
 
 		 371 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  41.89 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  41.05 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  41.05 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  42.78 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  49.63 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  39.56 
 
 		 222 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  39.56 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  44.76 
 
 		 156 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  44.76 
 
 		 156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  44.76 
 
 		 157 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  40 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  41.67 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  40.24 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  38.82 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  45.77 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  45.7 
 
 		 174 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  40.78 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  45 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  40.64 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  42.77 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  34.8 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  47.18 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  48.41 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.12 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  47.29 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  42.86 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  41.72 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  41.72 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  34.97 
 
 		 177 aa  99.8  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  36.41 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  36.76 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  40.4 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  48.03 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  46.83 
 
 		 159 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  42.48 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  37.74 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  48.82 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  35.53 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  40.24 
 
 		 579 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  48.03 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  49.19 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  44.16 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  41.38 
 
 		 144 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  36.59 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  38 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  36.48 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  33.11 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  35.21 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  35.71 
 
 		 646 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  30.41 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  33.79 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  33.79 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  33.33 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  45.45 
 
 		 139 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  34.23 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  34.19 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  35.4 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  30.3 
 
 		 659 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  33.13 
 
 		 526 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  33.13 
 
 		 526 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  31.14 
 
 		 645 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  31.14 
 
 		 645 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  31.14 
 
 		 645 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  33.13 
 
 		 526 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  30.3 
 
 		 659 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  33.13 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  24.61 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  31.29 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  31.29 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  29.53 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  29.53 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  30 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  30.18 
 
 		 649 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  29.17 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  29.19 
 
 		 661 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  32.23 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  29.19 
 
 		 661 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  31.4 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  31.4 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  31.4 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  29.93 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  30.4 
 
 		 190 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  29.27 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  28.87 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  32.03 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  27.86 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  27.86 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  27.42 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  25.17 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  28.85 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>