87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3154 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
159 aa  309  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  60 
 
 
189 aa  167  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  53.79 
 
 
240 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  58.14 
 
 
220 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  57.36 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  53.79 
 
 
235 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  54.86 
 
 
248 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  54.81 
 
 
215 aa  160  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  58.46 
 
 
222 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  58.46 
 
 
222 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  66.41 
 
 
157 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  65.65 
 
 
156 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  66.67 
 
 
156 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  59.33 
 
 
184 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  58.14 
 
 
219 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  61.48 
 
 
139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  56.03 
 
 
205 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  53.54 
 
 
177 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  54.33 
 
 
177 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  51.03 
 
 
183 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  51.45 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  55.56 
 
 
144 aa  136  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  55.94 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  56.52 
 
 
187 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  55.8 
 
 
187 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  44.23 
 
 
371 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  52.17 
 
 
187 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  36.5 
 
 
177 aa  114  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  37.21 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  39.04 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.58 
 
 
177 aa  111  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  43.67 
 
 
228 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  45.38 
 
 
240 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  44.52 
 
 
216 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  43.84 
 
 
216 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  42.75 
 
 
231 aa  97.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  39.69 
 
 
174 aa  94.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  36.42 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  36.73 
 
 
172 aa  87.8  5e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  39.46 
 
 
243 aa  88.2  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  46.46 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  37.5 
 
 
228 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  36.67 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  44.19 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.28 
 
 
236 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  35.88 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  42.07 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  39.29 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  40.14 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  41.22 
 
 
233 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  38.97 
 
 
244 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.1 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  36.5 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  36.76 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  36.76 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  39.69 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  34.07 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  36.6 
 
 
250 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  35.17 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  28.95 
 
 
248 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  32.26 
 
 
526 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  32.26 
 
 
526 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  32.26 
 
 
526 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  33.03 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  33.03 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  31.47 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  28.68 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  30 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  27.92 
 
 
220 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  27.92 
 
 
220 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  47.37 
 
 
420 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  33.56 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  32.24 
 
 
177 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  25.33 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  25.33 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  25.33 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  25.33 
 
 
194 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  33 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  36.52 
 
 
646 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  26.03 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  26.03 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  27.08 
 
 
194 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  32.03 
 
 
579 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  30.66 
 
 
506 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  31.31 
 
 
649 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  26.9 
 
 
221 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  26.9 
 
 
221 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>