77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2490 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 165 aa  336  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  65.75 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  63.7 
 
 		 165 aa  201  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  63.7 
 
 		 165 aa  201  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  46.95 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  47.88 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  44.24 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  43.94 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  34.5 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  38.97 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  35.62 
 
 		 248 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  33.91 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  33.72 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  36.11 
 
 		 215 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  39.19 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  35.17 
 
 		 220 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  39.46 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  39.19 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  35.07 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  35.07 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  37.59 
 
 		 219 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  39.53 
 
 		 184 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  37.14 
 
 		 187 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  36.11 
 
 		 215 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  35.07 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  34.56 
 
 		 235 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  33.1 
 
 		 240 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  33.81 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  33.78 
 
 		 174 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  35.57 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  38.64 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  40 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  36.48 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  37.4 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  34.29 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  34.29 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  36.03 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  37.78 
 
 		 579 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  34.19 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  32.75 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  33.55 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  32.9 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  33.77 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  33.1 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  32.74 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  32.67 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  30.59 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  28.03 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  34.38 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  32.45 
 
 		 371 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  32.24 
 
 		 526 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  32.24 
 
 		 526 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  32.24 
 
 		 526 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  28.89 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  32.19 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  35.21 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  31.54 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  27.54 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  35.25 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  30.82 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  55.36 
 
 		 420 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  31.11 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  32.59 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  33.07 
 
 		 525 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  31.98 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  32.33 
 
 		 659 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  30.19 
 
 		 661 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  30.19 
 
 		 661 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  33.08 
 
 		 659 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  34.13 
 
 		 248 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  29.37 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  28.07 
 
 		 612 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  32.03 
 
 		 649 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  28.8 
 
 		 197 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  25 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25 
 
 		 514 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  32.82 
 
 		 646 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>