90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3485 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  49.33 
 
 
174 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  42.77 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  42.38 
 
 
172 aa  109  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  42.76 
 
 
371 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  42.07 
 
 
183 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  36.72 
 
 
177 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  45.99 
 
 
185 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  40.91 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.69 
 
 
177 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  41.67 
 
 
190 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  38.57 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  42.48 
 
 
228 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  38.57 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  39.1 
 
 
177 aa  95.9  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  39.61 
 
 
216 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  40.79 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  41.13 
 
 
215 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  46.56 
 
 
205 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  41.3 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  39.01 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  39.57 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  39.23 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  41.22 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  35.26 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  34.18 
 
 
243 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  36.23 
 
 
189 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  36.71 
 
 
176 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  40.14 
 
 
177 aa  89  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  40.14 
 
 
177 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  38.81 
 
 
144 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  34.52 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  35.22 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  36.71 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  39.69 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  36.94 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  39.69 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  41.3 
 
 
579 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  34.52 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  40.31 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.58 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  41.04 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  41.04 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  41.04 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  41.22 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  34.42 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  35.33 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  32.64 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  41.46 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  31.55 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  32.05 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  37.4 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  30.82 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  30.39 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  31.48 
 
 
177 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  32.06 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  31.11 
 
 
167 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  32.59 
 
 
165 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  30.52 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  33.13 
 
 
525 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  34.96 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  30.43 
 
 
514 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  34.96 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  32.35 
 
 
165 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  26.62 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  26.62 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  26.61 
 
 
649 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  28.93 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  28.93 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  31.58 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  29.14 
 
 
526 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  29.66 
 
 
165 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  29.66 
 
 
165 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  29.14 
 
 
526 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  29.14 
 
 
526 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  29.63 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  29.22 
 
 
661 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  29.22 
 
 
661 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  28.76 
 
 
659 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0696  peptidase U35 phage prohead HK97  28.38 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  5.2787e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  24.63 
 
 
562 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  26.88 
 
 
659 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  29.45 
 
 
646 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  34.15 
 
 
586 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  29.6 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  29.1 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  29.53 
 
 
645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  29.53 
 
 
645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  29.53 
 
 
645 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  33.33 
 
 
600 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>