84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1077 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
187 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  89.25 
 
 
187 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  89.25 
 
 
187 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  59.09 
 
 
183 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  64.43 
 
 
190 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  66.44 
 
 
205 aa  181  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  65.77 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  54.74 
 
 
144 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  53.49 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  53.49 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  52.14 
 
 
248 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  52.08 
 
 
174 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  50.33 
 
 
219 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  44.13 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  45.14 
 
 
177 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  50 
 
 
215 aa  134  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  48.95 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  51.77 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  48.94 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  56.15 
 
 
156 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  56.15 
 
 
156 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  56.15 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  51.15 
 
 
235 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  51.88 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  47.37 
 
 
184 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  47.83 
 
 
189 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  48.91 
 
 
371 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  57.78 
 
 
139 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  42.77 
 
 
231 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  42.75 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  41.73 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  42.86 
 
 
240 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  34.66 
 
 
177 aa  108  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  49.19 
 
 
228 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  34.59 
 
 
177 aa  104  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  36.13 
 
 
177 aa  101  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  38.62 
 
 
172 aa  101  8e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  39.01 
 
 
165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  41.72 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  48.46 
 
 
149 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  41.72 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  39.08 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  37.14 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  44.76 
 
 
150 aa  95.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  40.91 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  36.71 
 
 
244 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  37.29 
 
 
168 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  39.46 
 
 
233 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  33.57 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  33.57 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  40.62 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  35.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  35.04 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.39 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  34.85 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  37.18 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.68 
 
 
579 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  33.33 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  27.38 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  24.03 
 
 
562 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  30 
 
 
198 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.97 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.97 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  27.03 
 
 
248 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  30.72 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  30.72 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  30.26 
 
 
177 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  30 
 
 
526 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  30 
 
 
526 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  30 
 
 
526 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  23.97 
 
 
239 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  30.49 
 
 
514 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  27.06 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  27.06 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  34.41 
 
 
612 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  30.17 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  30.15 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  31.25 
 
 
646 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>