68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1483 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 
165 aa  331  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 
165 aa  331  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  64.2 
 
 
165 aa  218  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  65.07 
 
 
165 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  47.27 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  43.71 
 
 
168 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  43.03 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  38.33 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  37.12 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  36.65 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  38.51 
 
 
222 aa  85.1  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  38.51 
 
 
222 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  36.75 
 
 
186 aa  84  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  38.18 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  32.5 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  36.24 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  36.24 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  38.06 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  38.06 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  39.37 
 
 
215 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  40.31 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  38.57 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  38.06 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  37.8 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  33.11 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  33.57 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  33.55 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  35.88 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  35.46 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  31.62 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  34.04 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  30.67 
 
 
240 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  36.64 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  29.3 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  31.52 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  32.17 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  32.17 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  33.33 
 
 
216 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  32.35 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  32.47 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  32.9 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.21 
 
 
579 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  32.43 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  38.54 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  34.31 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  35.76 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
243 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  29.11 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  31.13 
 
 
231 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  26.17 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  31.37 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  32.86 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  31.03 
 
 
233 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  28.74 
 
 
244 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  27.7 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  30.82 
 
 
526 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  30.82 
 
 
526 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  31.03 
 
 
248 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  30.82 
 
 
526 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  31.25 
 
 
236 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  33.33 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  42.37 
 
 
420 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  34.62 
 
 
646 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  30.72 
 
 
659 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  34.45 
 
 
248 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  29.45 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  28.76 
 
 
659 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>