101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1337 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  64.47 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  64.47 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  54.4 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  60.28 
 
 		 157 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  59.57 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  59.57 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  61.07 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  52.48 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  52.86 
 
 		 248 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  60.8 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  54.74 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  53.57 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  54.68 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  51.82 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  47.22 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  48.26 
 
 		 177 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  44.62 
 
 		 371 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  52.48 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  52.63 
 
 		 205 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  46.9 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.95 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  45.57 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  41.88 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  39.76 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  46.45 
 
 		 231 aa  121  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  48.91 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  37.5 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  44.97 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  47.41 
 
 		 139 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  49.28 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  44.94 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  48.94 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  47.83 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  40.38 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  37.72 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  43.71 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  43.71 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  40.36 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  42.86 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  34.71 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  38.18 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  41.61 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  41.29 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  40.88 
 
 		 236 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  38.04 
 
 		 243 aa  97.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  36.23 
 
 		 244 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  39.46 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  42.22 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  38.04 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  38.93 
 
 		 149 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  43.07 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  40.65 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  38.41 
 
 		 165 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  39.26 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  37.41 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  41.13 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  41.13 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  33.33 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  35.21 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  34.19 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  32.61 
 
 		 526 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  32.61 
 
 		 526 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  32.61 
 
 		 526 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  30.2 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  32.69 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  32.24 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  34.96 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  31.79 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  31.79 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  34.19 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  34.19 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  32.24 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  32.24 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.92 
 
 		 579 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  34.06 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  31.52 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  31.52 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  31.52 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  31.52 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  30.67 
 
 		 646 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  31.58 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  29.71 
 
 		 506 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  30.4 
 
 		 659 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  32.26 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  27.7 
 
 		 562 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  33.82 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  29.6 
 
 		 659 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  30.65 
 
 		 649 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  29.84 
 
 		 661 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  29.84 
 
 		 661 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  31.07 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  28.93 
 
 		 514 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3891  peptidase U35 phage prohead HK97  26.47 
 
 		 249 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472754 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  28.21 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  31.88 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  29.19 
 
 		 645 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  29.19 
 
 		 645 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  29.19 
 
 		 645 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  31.36 
 
 		 600 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>