89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3395 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  43.62 
 
 
240 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  39.57 
 
 
231 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  35.45 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  44.52 
 
 
176 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  38.96 
 
 
240 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  35.68 
 
 
233 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  38.89 
 
 
172 aa  101  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  41.57 
 
 
228 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  41.54 
 
 
248 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  37.36 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  37.36 
 
 
216 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  40.91 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  39.39 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  40.88 
 
 
189 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  38.26 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  40.4 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  38.26 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  37.06 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.17 
 
 
177 aa  92  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  36.43 
 
 
177 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  33.69 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  33.69 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  32.3 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  33.54 
 
 
177 aa  89  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  35.19 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  33.73 
 
 
371 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  37.76 
 
 
150 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  40.91 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  41.54 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  39.07 
 
 
177 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  41.54 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  39.07 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  31.13 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  36.73 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  41.54 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  38.52 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  36.3 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  38.58 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  32.87 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  35.22 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  38.67 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
144 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  38.58 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  35.66 
 
 
579 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  34.64 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  33.16 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  37.91 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  36.36 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  29.94 
 
 
526 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  29.94 
 
 
526 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  29.94 
 
 
526 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  33.59 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  34.38 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  34.23 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  30.19 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  33.56 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  31.43 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  34.46 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  30.71 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  30.46 
 
 
171 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  34.35 
 
 
139 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  31.34 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  30.94 
 
 
177 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0696  peptidase U35 phage prohead HK97  28.12 
 
 
198 aa  52.4  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  5.2787e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  31.75 
 
 
659 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  29.01 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  26.81 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  31.25 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  31.25 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  24.87 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  29.37 
 
 
659 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  26.52 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  26.52 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  30.16 
 
 
661 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  30.16 
 
 
661 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  28.24 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  26.05 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  26.51 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  28.03 
 
 
177 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  25.2 
 
 
562 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  27.7 
 
 
203 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.76334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>