90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0648 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  67.38 
 
 
240 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  57.52 
 
 
233 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  59.65 
 
 
228 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  56.28 
 
 
248 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  50.48 
 
 
216 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  50 
 
 
216 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  42.73 
 
 
371 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  47.03 
 
 
219 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  41.09 
 
 
222 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  41.09 
 
 
222 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  43.87 
 
 
177 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  45.33 
 
 
177 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  41.2 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  50.71 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  39.88 
 
 
177 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  46.48 
 
 
220 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  45.77 
 
 
248 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  45.7 
 
 
176 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  41.61 
 
 
172 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.73 
 
 
177 aa  123  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  46.76 
 
 
235 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  46.45 
 
 
189 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  48.46 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  42.78 
 
 
228 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  51.11 
 
 
156 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  44.59 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  42.96 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  51.11 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  43.24 
 
 
215 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  50.37 
 
 
157 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  38.86 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  43.4 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  42 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  38.07 
 
 
243 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  39.57 
 
 
236 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  42.77 
 
 
187 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  47.69 
 
 
205 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  41.51 
 
 
187 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  41.51 
 
 
187 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  42.94 
 
 
185 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  43.61 
 
 
144 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  38.57 
 
 
183 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  45.52 
 
 
184 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  40.79 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  42.75 
 
 
159 aa  92  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  38.41 
 
 
171 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  39.13 
 
 
168 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  38.61 
 
 
149 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  38.17 
 
 
579 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  36.76 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  35.21 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  32.39 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  31.63 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  41.18 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  32.67 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  29.94 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  32.28 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  41.28 
 
 
646 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  30.77 
 
 
526 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  30.77 
 
 
526 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  30.77 
 
 
526 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  31.13 
 
 
165 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  31.13 
 
 
165 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  31.97 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.75 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  30.92 
 
 
169 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  33.64 
 
 
645 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  29.03 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  33.64 
 
 
645 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  33.64 
 
 
645 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  27.5 
 
 
198 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  32.38 
 
 
649 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  31.79 
 
 
612 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  29.5 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  29.5 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  29.5 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  29.5 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  33.33 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  28.08 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  28.89 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  28.89 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  28.23 
 
 
525 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  32.11 
 
 
659 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  32.8 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  31.19 
 
 
659 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  28.12 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  28.12 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  35.51 
 
 
586 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>