75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4964 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
184 aa  346  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  74.29 
 
 
156 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  74.29 
 
 
156 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  74.29 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  65.15 
 
 
222 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  65.15 
 
 
222 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  60.61 
 
 
189 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  61.65 
 
 
219 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  61.9 
 
 
159 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  60.15 
 
 
215 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  48.73 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  59.54 
 
 
248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  52.86 
 
 
177 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  57.89 
 
 
215 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  52.14 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  57.14 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  48.82 
 
 
183 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  58.65 
 
 
240 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  57.58 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  51.16 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  56.15 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  53.49 
 
 
144 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  55.38 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  46.2 
 
 
187 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  46.2 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  46.2 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  40.15 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  46.56 
 
 
371 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  42.58 
 
 
174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  52.31 
 
 
139 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  35.21 
 
 
177 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  47.76 
 
 
240 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  47.29 
 
 
228 aa  104  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  35.92 
 
 
177 aa  103  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  45.52 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  43.18 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  42.11 
 
 
228 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  44.44 
 
 
216 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  44.44 
 
 
216 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  42.75 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  40.6 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  39.53 
 
 
165 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  37.23 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  34.13 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  44.29 
 
 
233 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  36.9 
 
 
236 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  41.61 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  43.08 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  40.85 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  41.54 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  37.5 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  40.31 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  40.31 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  37.86 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  35.33 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  38.31 
 
 
250 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  43.31 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  35.07 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  35.07 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  29.45 
 
 
248 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  37.69 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.96 
 
 
579 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  31.47 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  33.77 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  32.35 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  32.35 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  32 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  34.11 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  33.1 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  34.92 
 
 
526 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  34.92 
 
 
526 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  34.92 
 
 
526 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  26.28 
 
 
514 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  44.9 
 
 
420 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  30.99 
 
 
201 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>