92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2175 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  100 
 
 		 205 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  58.38 
 
 		 183 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  62.71 
 
 		 187 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  63.82 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  62.15 
 
 		 187 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  67.3 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  61.63 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  61.07 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  61.07 
 
 		 222 aa  167  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  52.87 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  52.87 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  49.69 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  52.87 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  58.33 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  54.96 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  48.72 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  46.25 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  52.08 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  54.2 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  55.64 
 
 		 144 aa  147  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  55.73 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  58.78 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  58.78 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  56.15 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  58.02 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  60.15 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  47.97 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  52.71 
 
 		 371 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  43.53 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  36.52 
 
 		 177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  47.69 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  44.37 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  41.51 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  44.74 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  45.71 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  39.23 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  48.03 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  45.71 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.46 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  41.11 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  33.99 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  42.95 
 
 		 168 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  39.35 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  39.72 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  45.52 
 
 		 149 aa  94.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  41.98 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.72 
 
 		 248 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  41.18 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  36.94 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  32.97 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  39.24 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  37.16 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  36.6 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  36.7 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  37.41 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  37.4 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  37.4 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  38.84 
 
 		 579 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  31.16 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  33.09 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.32 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  26.44 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  26.44 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  26.28 
 
 		 562 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  29.73 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  30.71 
 
 		 645 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  30.71 
 
 		 645 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  30.71 
 
 		 645 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  28.48 
 
 		 526 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  30 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  28.48 
 
 		 526 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  28.48 
 
 		 526 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  29.1 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  27.16 
 
 		 525 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  27.03 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  35.64 
 
 		 646 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  30.5 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0696  peptidase U35 phage prohead HK97  29.61 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.2787e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  30.63 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  29.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  30.63 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  30.39 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.39 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.39 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  33.33 
 
 		 514 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  40.68 
 
 		 420 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  28.69 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  28.69 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  28.69 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  28.69 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  26 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>