89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2095 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  100 
 
 
248 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  76.57 
 
 
240 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  78.42 
 
 
235 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  72.17 
 
 
220 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  64 
 
 
215 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  65.69 
 
 
215 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  55.88 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  52.86 
 
 
189 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  52.11 
 
 
177 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  52.11 
 
 
177 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  54.41 
 
 
222 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  54.41 
 
 
222 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  55.3 
 
 
159 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  59.09 
 
 
156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  59.09 
 
 
156 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  59.54 
 
 
184 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  50.35 
 
 
183 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  49.69 
 
 
205 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  47.55 
 
 
176 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  58.33 
 
 
157 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  50.71 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  54.55 
 
 
144 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  55.4 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  51.77 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  51.77 
 
 
187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  37.5 
 
 
177 aa  125  6e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  45.77 
 
 
231 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  52.14 
 
 
187 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.03 
 
 
177 aa  124  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  37.84 
 
 
177 aa  122  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  43.57 
 
 
371 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  45.14 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  49.63 
 
 
139 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  44.85 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  45.77 
 
 
228 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  43.36 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  39.29 
 
 
172 aa  105  8e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  42 
 
 
216 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  41.06 
 
 
216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.46 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  34.13 
 
 
183 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  40.41 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  41.1 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  39.73 
 
 
186 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  35.62 
 
 
165 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  39.23 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  37.99 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  38.51 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  38.1 
 
 
165 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  35.47 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  37.11 
 
 
171 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  31.45 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  37.5 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  42.22 
 
 
150 aa  82  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  38.22 
 
 
149 aa  82  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  35.86 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  33.79 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  33.79 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  29.3 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  33.93 
 
 
177 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  31.21 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.84 
 
 
579 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  24.76 
 
 
506 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  29.9 
 
 
646 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  29.41 
 
 
526 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  29.41 
 
 
526 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  29.41 
 
 
526 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.89 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.89 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.53 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  29.58 
 
 
194 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  30.43 
 
 
169 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  29.73 
 
 
186 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  27.14 
 
 
190 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  28.21 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  28.21 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  28.21 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  32.35 
 
 
177 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  27.81 
 
 
194 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  40 
 
 
420 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  26.71 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  26.71 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  31.82 
 
 
645 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  28.83 
 
 
203 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  31.82 
 
 
645 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  31.82 
 
 
645 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  26 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  26 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  30.28 
 
 
649 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>