74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2000 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 149 aa  284  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  53.38 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  44.62 
 
 		 183 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  49.19 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  49.22 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  49.22 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  47.66 
 
 		 190 aa  93.2  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  50 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  38.61 
 
 		 231 aa  90.5  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  48.89 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  35.1 
 
 		 174 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  48.15 
 
 		 187 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  47.69 
 
 		 187 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  36.81 
 
 		 172 aa  87  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  42 
 
 		 216 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  41.33 
 
 		 216 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  44.03 
 
 		 220 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  37.97 
 
 		 240 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  38.93 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  41.18 
 
 		 219 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  41.35 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  41.35 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  32.65 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  42.11 
 
 		 235 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  45.52 
 
 		 205 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  46.34 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  38.41 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  42.96 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  37.89 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  41.35 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  41.35 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  33.96 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  46.32 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  40.15 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.58 
 
 		 236 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  40 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  40 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  41.22 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  40 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  40.15 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  38.81 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  30.3 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  37.5 
 
 		 233 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  36.17 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  39.83 
 
 		 579 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  43.31 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  38.35 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  34.19 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  28.97 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  34.75 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  37.5 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  31.54 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  35.37 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  34.09 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  36.36 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  37.86 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  37.06 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  33.59 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  33.59 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  43.16 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  30.87 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  32.67 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  30.97 
 
 		 213 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  30.46 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  30.23 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  30.46 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  35.94 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  33.09 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  30.15 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0696  peptidase U35 phage prohead HK97  28.78 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.2787e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  29.66 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  29.66 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  28.47 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  28.47 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>