80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3708 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
371 aa  744    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3555  phage-associated protein, HI1409 family  58.33 
 
 
674 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  47.09 
 
 
222 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  47.09 
 
 
222 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6253  phage-associated protein, HI1409 family  52.29 
 
 
620 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6998  phage-associated protein, HI1409 family  52.94 
 
 
618 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  39.56 
 
 
240 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  42.73 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  45.77 
 
 
219 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  44.62 
 
 
189 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  38.01 
 
 
228 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  47.24 
 
 
177 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  47.24 
 
 
177 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  44.06 
 
 
216 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  42.72 
 
 
216 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2718  hypothetical protein  50.98 
 
 
634 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  43.39 
 
 
228 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  43.51 
 
 
233 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  39.32 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  40.59 
 
 
176 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  45.03 
 
 
215 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  43.84 
 
 
177 aa  128  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  48.95 
 
 
190 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  38.5 
 
 
233 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  51.88 
 
 
183 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  41.29 
 
 
177 aa  125  9e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  42.28 
 
 
240 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  41.26 
 
 
213 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  40 
 
 
177 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  47.89 
 
 
156 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  46.45 
 
 
174 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  42.28 
 
 
235 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  47.89 
 
 
156 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  44.5 
 
 
243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  43.57 
 
 
248 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  46.04 
 
 
220 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  49.3 
 
 
157 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  47.37 
 
 
159 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  42.08 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  38.64 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  48.91 
 
 
187 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  52.71 
 
 
205 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  42.86 
 
 
183 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  48.18 
 
 
187 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  48.18 
 
 
187 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  41.61 
 
 
172 aa  112  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  47.1 
 
 
185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  46.56 
 
 
184 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  42.76 
 
 
244 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  43.61 
 
 
144 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  34.93 
 
 
186 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  33.73 
 
 
236 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  46.74 
 
 
139 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  40.12 
 
 
579 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  42.96 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  37.58 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  38.73 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  41.3 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  35.71 
 
 
171 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  34.27 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  31.17 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  34.81 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  32.45 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  32.45 
 
 
165 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  32.45 
 
 
165 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  34.81 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  34.81 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  32.91 
 
 
180 aa  67  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  35.76 
 
 
177 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  35.85 
 
 
646 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  29.24 
 
 
649 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  27.17 
 
 
194 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  26.82 
 
 
196 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  26.82 
 
 
196 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  30.19 
 
 
645 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  30.19 
 
 
645 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  30.19 
 
 
645 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  31.13 
 
 
659 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  26.43 
 
 
562 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  40.62 
 
 
600 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>