36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2636 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  75.66 
 
 		 184 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  36.78 
 
 		 233 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  40.15 
 
 		 514 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  38.58 
 
 		 506 aa  78.6  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  38.71 
 
 		 562 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  39.53 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  30.37 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  39.53 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  35.71 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  35.65 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  34.92 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  34.78 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  31.06 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  31.06 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  31.39 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  34.78 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  26.92 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  31.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.47 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.47 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  29.46 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  29.46 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  29.46 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  33.83 
 
 		 199 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  36.59 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  29.6 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  36.59 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  39.02 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  33.97 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  31.2 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  34.48 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  34.48 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  28.87 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  28.23 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  26.05 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>