48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4282 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  54.99 
 
 		 659 aa  673    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  100 
 
 		 661 aa  1320    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  54.55 
 
 		 659 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  100 
 
 		 661 aa  1320    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  69.64 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  46.98 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  47.51 
 
 		 649 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  46.98 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  46.98 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  46.77 
 
 		 646 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  39.23 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  36.99 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  60.87 
 
 		 206 aa  211  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  54.14 
 
 		 177 aa  183  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  36.14 
 
 		 357 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  35.6 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  40 
 
 		 197 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  46.71 
 
 		 525 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  26.56 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  23.11 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  25.1 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  35.66 
 
 		 218 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  22.88 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  32.47 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  29.5 
 
 		 172 aa  58.5  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  32.73 
 
 		 240 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  23.87 
 
 		 437 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.13 
 
 		 438 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  31.75 
 
 		 171 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  28.48 
 
 		 177 aa  54.3  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  31.78 
 
 		 228 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  24.17 
 
 		 409 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  28.29 
 
 		 174 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  29.22 
 
 		 244 aa  51.2  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  28.93 
 
 		 180 aa  50.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2687  peptidase U35 phage prohead HK97  34.04 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  29.19 
 
 		 228 aa  50.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  30.19 
 
 		 165 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  27.2 
 
 		 177 aa  50.1  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  23.99 
 
 		 472 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  29.84 
 
 		 189 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  30.16 
 
 		 236 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  22.09 
 
 		 624 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  22.09 
 
 		 624 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  30.77 
 
 		 216 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  28.89 
 
 		 165 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  30.77 
 
 		 216 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  26.37 
 
 		 416 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>