52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4080 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  59.85 
 
 		 649 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  96.51 
 
 		 659 aa  1288    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  54.55 
 
 		 661 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  100 
 
 		 659 aa  1329    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  54.55 
 
 		 661 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  44.48 
 
 		 646 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  42.92 
 
 		 645 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  42.92 
 
 		 645 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  42.92 
 
 		 645 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  42.61 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  44.09 
 
 		 469 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  39.82 
 
 		 431 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  54.4 
 
 		 206 aa  203  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  34.05 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  32.53 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  44.62 
 
 		 177 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  45.45 
 
 		 525 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  41.8 
 
 		 197 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  26.02 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  25.89 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.88 
 
 		 490 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  25.89 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  27.81 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  23.92 
 
 		 472 aa  70.5  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  30.3 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  25.63 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  30.5 
 
 		 172 aa  62.4  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  23.71 
 
 		 624 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  35.71 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  24.39 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  30.07 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  30.07 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  23.31 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  33.12 
 
 		 168 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  31.41 
 
 		 218 aa  54.7  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  28.86 
 
 		 177 aa  53.5  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  22.57 
 
 		 279 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  31.21 
 
 		 171 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  33.03 
 
 		 228 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  28.75 
 
 		 177 aa  50.8  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  24.44 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  23.4 
 
 		 579 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  33.08 
 
 		 165 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.53 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  26.88 
 
 		 244 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  29.85 
 
 		 177 aa  48.5  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  29.6 
 
 		 189 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  29.37 
 
 		 236 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  29.37 
 
 		 165 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2687  peptidase U35 phage prohead HK97  31.79 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  28.22 
 
 		 174 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  31.19 
 
 		 231 aa  43.9  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>