202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0311 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0311  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2801  glycosyl transferase family protein  51.84 
 
 
274 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2033  hypothetical protein  27.85 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
1334 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
1340 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
415 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
632 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
723 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 
427 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  31.15 
 
 
1119 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
582 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
1509 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
610 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 
1162 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
785 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
555 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
1561 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.54 
 
 
700 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
602 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
1523 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
1359 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
430 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
616 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
1486 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
1759 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
334 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
625 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
625 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
1523 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 
809 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
796 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
1152 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
499 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
551 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
1152 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  26.49 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
742 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
742 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.37 
 
 
1644 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.37 
 
 
1644 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
551 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
658 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
1077 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 
355 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0397  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
709 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
775 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
709 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
1275 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
808 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
670 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
586 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  27.93 
 
 
341 aa  52.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
684 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
360 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
312 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
526 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
996 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  30.83 
 
 
1182 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  31.06 
 
 
785 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
880 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
539 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
576 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
684 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
635 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
733 aa  49.7  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
1067 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
506 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
556 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
704 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
625 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
333 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.81 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
705 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>