134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0397 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0397  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
1162 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
1340 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
785 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
358 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
472 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
376 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1697  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2309  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2332  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0311  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
476 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
841 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2348  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
616 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
1523 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
304 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
525 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
624 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2228  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
280 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4102  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
1523 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
557 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2801  glycosyl transferase family protein  22.52 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3627  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
379 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
582 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
679 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
1077 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
330 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.43 
 
 
338 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
348 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
342 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1960  teichoic acid biosynthesis protein F  25 
 
 
721 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
683 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  28.32 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  27.5 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
1739 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
297 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
1435 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.73 
 
 
2401 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
322 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
335 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
311 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
337 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2274  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
217 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.85 
 
 
337 aa  45.8  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
312 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
1268 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.63 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  32.17 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
457 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2203  hypothetical protein  29.35 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
746 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  21.78 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>