More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3804 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
582 aa  1200    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
1268 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
1435 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
785 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
280 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.02 
 
 
1119 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
369 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
337 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
302 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
1523 aa  94  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
557 aa  93.6  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
1739 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
616 aa  92.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
679 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
624 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
1523 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.44 
 
 
700 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.35 
 
 
2401 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
1340 aa  84.3  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
1077 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.23 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
1106 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
324 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
273 aa  79  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
1162 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
525 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.2 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
619 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
1152 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  27.38 
 
 
1837 aa  74.3  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
314 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
691 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
994 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.4 
 
 
860 aa  70.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
1759 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
691 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
691 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
1359 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
796 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  24.1 
 
 
1225 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
1334 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
902 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
430 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
996 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.15 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.24 
 
 
310 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
330 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
272 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
415 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
293 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
703 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
733 aa  64.3  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  26.34 
 
 
310 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
312 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  29.95 
 
 
314 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
324 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.82 
 
 
336 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
310 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
324 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0311  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
279 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.65 
 
 
1644 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
722 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
683 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.65 
 
 
1644 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  27.7 
 
 
1165 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  27.7 
 
 
1165 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  25.43 
 
 
338 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
339 aa  62  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  24.76 
 
 
274 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
279 aa  61.6  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
346 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
346 aa  61.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
333 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
338 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
714 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 
880 aa  60.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
310 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
303 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.23 
 
 
291 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
366 aa  60.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
290 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
749 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
401 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  23.22 
 
 
316 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
1486 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
988 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>