40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2033 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2033  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0311  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2801  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 511 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 308 aa  49.3  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 624 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 333 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.36 
 
 		 1119 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  26.98 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 714 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.15 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  52.38 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 679 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 1162 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2274  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 		 705 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 		 361 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 310 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>