More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0816 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0816  M20/M25/M40 family peptidase  100 
 
 
397 aa  812    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000910031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0497  amidohydrolase  50.64 
 
 
394 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00480371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  35.46 
 
 
389 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2455  amidohydrolase  34.56 
 
 
382 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  33.85 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  35.19 
 
 
390 aa  212  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  34.77 
 
 
391 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  34.77 
 
 
391 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  35.88 
 
 
393 aa  209  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  33.33 
 
 
394 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  32.59 
 
 
398 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  33.09 
 
 
466 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  32.84 
 
 
398 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  33.17 
 
 
394 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  33.08 
 
 
380 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1023  amidohydrolase  35.81 
 
 
388 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00286285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  31.89 
 
 
465 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  31.89 
 
 
465 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  31.87 
 
 
437 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  34.28 
 
 
389 aa  202  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  31.2 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  32.76 
 
 
435 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  32.99 
 
 
391 aa  199  9e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  30.96 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.98 
 
 
438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  31.41 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  32.72 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.45 
 
 
394 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  32.7 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  32.38 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  31.17 
 
 
403 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  31.14 
 
 
393 aa  196  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  34.05 
 
 
381 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 
381 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  32.93 
 
 
435 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  33.5 
 
 
438 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  31.45 
 
 
459 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  32.91 
 
 
390 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  32.46 
 
 
471 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.51 
 
 
381 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  30.27 
 
 
458 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  30.08 
 
 
404 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  31.14 
 
 
436 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  32.69 
 
 
465 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  31.78 
 
 
391 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  33.78 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  31.33 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  30.56 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  32.59 
 
 
449 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  32.99 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  33.69 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  31.75 
 
 
470 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  31.97 
 
 
431 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  31.77 
 
 
402 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  33.25 
 
 
395 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  30.13 
 
 
413 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  30.96 
 
 
449 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  31.14 
 
 
399 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  31.47 
 
 
410 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  29.85 
 
 
447 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  30.03 
 
 
405 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  32.62 
 
 
381 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1689  amidohydrolase  34.9 
 
 
385 aa  186  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  30.2 
 
 
405 aa  186  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  29.72 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  33.86 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.35 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  31.86 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.52 
 
 
389 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  31.55 
 
 
415 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  31.9 
 
 
408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  32.66 
 
 
392 aa  182  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  32.71 
 
 
381 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  32.89 
 
 
386 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  31.9 
 
 
389 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  32.1 
 
 
400 aa  182  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  29.62 
 
 
405 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  32.17 
 
 
389 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.84 
 
 
391 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  33.07 
 
 
393 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  32.45 
 
 
389 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  31.83 
 
 
389 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  32.44 
 
 
392 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.98 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  32.98 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  30.85 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  32.19 
 
 
389 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  32.19 
 
 
389 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.63 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  30.51 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  30.47 
 
 
432 aa  180  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  33.33 
 
 
400 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0093  amidohydrolase  31.6 
 
 
392 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  29.09 
 
 
423 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0090  amidohydrolase  31.6 
 
 
392 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  30.69 
 
 
430 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  29.92 
 
 
391 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  30.43 
 
 
391 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1923  carboxypeptidase  30.33 
 
 
423 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422754  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  32.06 
 
 
392 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>